Wie jeder Verein wird auch der Paritätische Baden-Württemberg von einem (hauptamtlichen) Vorstand geführt. Dem Vorstand obliegen die gerichtliche und außergerichtliche Vertretung des Verbandes sowie die Führung der laufenden Geschäfte des Verbandes.
Oberstes Organ des Vereins ist die Mitgliederversammlung, die (mindestens) einmal im Jahr tagt.
Der Vorstand wird durch einen Aufsichtsrat berufen, kontrolliert und erarbeitet mit diesem zusammen die strategischen Leitlinien des Verbands. Fachlich beraten und begleitet wird der Vorstand von einem ehrenamtlichen Fachbeirat. Weiterhin wir der Verband beraten von der Konferenz der Kreisverbandsvorsitzenden, die zweimal pro Jahr zusammenkommt.
In den Fachbereichen berät ein ehrenamtliches Kernteam die hauptamtlichen Mitarbeitenden des Verbands zu fachspezifischen Fragen und Positionen.